פרופ׳ אגבאריה נולד באום אל-פחם בשנת 1959 וסיים את הדוקטורט שלו ב-1990, בפרמקולוגיה קלינית בפקולטה למדעי הבריאות של אוניברסיטת בן-גוריון בנגב. בין השנים 1990-1994 התמחה במכון הלאומי למדעי הבריאות של ארה`ב, ביתזדא, מירלאנד, בפיתוח תרופות לסרטן ואיידס.
בתפקידיו הקודמים באוניברסטת בן-גוריון, הוא שימש כמנהל בית הספר לרוקחות. ב 2012 מונה כיועץ הרקטור לענייני סטודנטים ערבים, ובמסגרת פעילותו הוא יזם פרויקטים חברתיים רבים לקידום האוכלוסייה הערבית, לרבות `ניצני רפואה`, תוכנית העשרה והכנה ללימודי מקצועות הרפואה בקרב תלמידים בדואיים ועיירות פיתוח בנגב. הודות לתוכנית זו, יש כיום למעלה מ-100 בוגרים במקצועות הבריאות, בהן 12 רופאות בדואיות, וכיום (2016) לומדות 13 סטודנטיות בדואיות במסגרת התוכנית.